《药师经》是非常经典的经文，也是非常重要的经文，而《药师忏》是根据《药师经》全文 而做成的一种忏悔方法。接下来让我们一起来看一下，《药师经》和《药师忏》有哪些区别。
《药师经》，一般指《药师琉璃光如来本愿功德经》，由唐三藏法师玄奘奉诏译的佛经，是赞叹药师佛行愿的佛经，是大乘经典之一。《药师琉璃光如来本愿功德经 》中所说的药师佛居住教化的净琉璃世界，是佛教徒所向往的理想国土。那里的地面由琉璃构成，连药师佛的身躯，也如同琉璃一样内外光洁，所以称琉璃世界。佛经上说此世界和西方极乐世界一样，具有说不尽的庄严美妙;那里没有男女性别上的差异，没有五欲的过患;琉璃为地，金绳界道;城垣、宫殿都是七宝所成。人们只要在生前持诵《药师经》，称念药师佛名号，并广修众善，不但能够满世间诸愿，死后亦可往生净琉璃世界或极乐世界，速证菩提。
《药师忏》是以药师如来为本尊而举行的忏悔罪障的修行法门，是依据《药师如来本愿功德经》而作成的一种忏法。《药师忏》正是说明药师如来的誓愿而离苦得乐的行法，是天溪大觉寺受登在康熙三年(1664)纂集，称为《药师三昧行法》。《药师三昧行法》内容包括：(1)定名，叙述药师三昧名称的缘由;(2)劝修，劝诫修习本三昧，则所求长寿、富饶、官位、男女等，皆得顺遂;(3)方法，揭示供养药师如来的方法;(4)释疑，因当时往生西方净土的思想极为流行，所以作释疑，以肯定本行法为致福消灾之要法及明心作佛的秘典。
